GEN ANALİZ PLATFORMU • Biyoinformatik ve Dizi Analiz Sistemi

Genomik Analiz Stüdyosu Hazır

Sol paneldeki 10 doğrulanmış gen kütüphanesinden birini seçin, canlı NCBI Accession ID girin veya kendi FASTA dizinizi yapıştırarak analizi başlatın[span_5](start_span)[span_5](end_span)[span_6](start_span)[span_6](end_span).

Hedef Gen & Boyut

— bp

Veri bekleniyor

GC / AT Dengesi AT: %—

GC: %—

A: 0T: 0G: 0C: 0

Translasyon & Primer Çift: —

— Kodon

Tam Üçlü Okuma Kapasitesi

Moleküler Kütle Çift Zincir

— kDa

ssDNA: — kDa

Kalite Filtresi:

Gösterilen: 0 Çift

Seçili Amplikon Konum Haritası

5' Uç (1 bp)

İleri Primer Amplikon Geri Primer

3' Uç

PCR Protokolü & MasterMix

Sanal Agaroz Jel Elektroforezi (%1.5 TAE • UV 302 nm)

Logaritmik göç modeli ile yaklaşık görsel simülasyon; gerçek jel/ölçüm yerine geçmez

1 Kesim • 2 Bant

UV 302 nm Transilluminator

EcoRI • 5'-G^AATTC-3'

Enzimatik Kesim Raporu

Herhangi bir enzime tıklayarak doğrudan Agaroz Jel simülasyonundaki bant profilini görüntüleyebilirsiniz[span_7](start_span)[span_7](end_span).

pET-28a Omurga Gen İnserti KanR / Ori (şematik)

pET-28a (+) Çoklu Klonlama Bölgesi (MCS) Uyumluluk Matrisi

Standart restriksiyon-ligasyon klonlaması için seçilen enzimin genin kendi içini kesmemesi (0 iç kesim) gerekir[span_8](start_span)[span_8](end_span). Sol taraftaki plazmid haritası, geninizin büyüklüğüne göre ölçeklenmiş gerçek rekombinant yapıyı gösterir[span_9](start_span)[span_9](end_span):

Açık Okuma Çerçevesi (ORF) & Biyokimyasal Peptit Analizi

Aktif gen dizisinin gerçek kodon tablosu ile hesaplanan en uzun okuma çerçevesi ve amino asit polarite dağılımı[span_10](start_span)[span_10](end_span)[span_11](start_span)[span_11](end_span).

Çerçeve: +1

Peptit Uzunluğu

— aa

—

Protein Kütlesi

— kDa

Susuz Peptit Bağı[span_12](start_span)[span_12](end_span)[span_13](start_span)[span_13](end_span)

Hidrofobik Oran

%—

A, V, I, L, M, F, Y, W[span_14](start_span)[span_14](end_span)[span_15](start_span)[span_15](end_span)

Yüklü (Asidik/Bazik)

%—

D, E, K, R, H Rezidüleri[span_16](start_span)[span_16](end_span)[span_17](start_span)[span_17](end_span)

Translasyon Amino Asit Dizisi (Biyokimyasal Renk Kodlu):

Hidrofobik Polar (Yüksüz) Bazik (+) Asidik (-)

Site-Directed Mutagenesis (Yönlendirilmiş Nokta Mutasyonu)

Pozisyonu seçtiğiniz anda mevcut baz ve bulunduğu üçlü kodon aşağıda canlı olarak görüntülenir[span_18](start_span)[span_18](end_span).

Önizleme için bir gen analizi çalıştırın.

Hedef Pozisyon (1 .. N bp)

Yeni Nükleotid

E. coli K12 Yüksek Ekspresyon Kodon Optimizasyonu

Ham DNA dizisini veya aktif geninizi E. coli K12 en yüksek frekanslı tRNA kodonlarına dönüştürün[span_19](start_span)[span_19](end_span)[span_20](start_span)[span_20](end_span).

Çoklu (Batch) FASTA Sekans Tarayıcı

Birden fazla FASTA sekansını >Başlık formatında alt alta girerek toplu GC, kütle ve Primer3 taraması yapın[span_21](start_span)[span_21](end_span).

Tüm hesaplar sunucuda yapılır; geçersiz/imkânsız girdide sonuç yerine hata verilir. Birimleri tutarlı girin[span_22](start_span)[span_22](end_span)[span_23](start_span)[span_23](end_span).

Seyreltme (C1·V1 = C2·V2)[span_24](start_span)[span_24](end_span)[span_25](start_span)[span_25](end_span)

Ligasyon (Insert:Vektör molar oran)[span_26](start_span)[span_26](end_span)[span_27](start_span)[span_27](end_span)

PCR MasterMix (2× mix, %10 pay)[span_28](start_span)[span_28](end_span)[span_29](start_span)[span_29](end_span)

İnteraktif Sekans Gezgini (10'lu Blok & Koordinat İndeksli)

Dizi içinde belirli bir motifi arayın, 5'→3' Düz veya Ters Tamamlayıcı (Reverse Complement) diziyi inceleyin[span_30](start_span)[span_30](end_span).

0 Eşleşme